La mitilicultura regional ante un año de definiciones

La Región de Los Lagos concentra más del 85% de la producción nacional de mejillón (Mytilus chilensis), consolidándose como el principal clúster mitilicultor de América Latina. Sin embargo, el cierre del primer trimestre de 2025 ha encontrado al sector en una encrucijada: por un lado, las exportaciones de mitílidos chilenos superaron los USD 320 millones en 2024, según cifras de ProChile, marcando un récord histórico impulsado por la demanda europea y asiática. Por otro, episodios recurrentes de Floraciones Algales Nocivas (FAN) y la entrada en vigor de nuevas exigencias sanitarias en mercados destino amenazan con frenar ese impulso justo cuando el sector necesita consolidar su crecimiento. Para los productores, empresas de proceso y emprendedores vinculados a la cadena de valor acuícola de Los Lagos, entender este mapa de fuerzas es hoy una necesidad estratégica.

Exportaciones de mejillón: récord con pies de barro

Los datos de SERNAPESCA correspondientes al cierre de 2024 confirman que la cosecha de mejillón en la región alcanzó las 312.000 toneladas en peso vivo, un alza del 7% respecto al año anterior. España, Francia e Italia siguen siendo los principales destinos en Europa, mientras que Corea del Sur y Japón ganan participación en el bloque Asia-Pacífico. La presentación en media concha congelada lidera el mix exportador con cerca del 60% del volumen, pero los formatos de mayor valor agregado —mejillón ahumado, en escabeche y conservas gourmet— crecieron un 18% interanual, según el reporte de comercio exterior de ProChile Puerto Montt.

No obstante, este escenario positivo convive con una fragilidad estructural: la dependencia de pocos mercados y la volatilidad del tipo de cambio. El fortalecimiento del peso chileno durante el primer semestre de 2025 recortó márgenes en varias plantas procesadoras de la provincia de Chiloé, obligando a renegociar contratos y a acelerar planes de eficiencia operacional que muchas empresas medianas aún tienen pendientes.

Mareas rojas y FAN: el riesgo que no desaparece

La marea roja —o más precisamente las FAN producidas por microalgas como Alexandrium catenella— sigue siendo el factor de riesgo más disruptivo para la mitilicultura regional. El Servicio Nacional de Pesca y Acuicultura (SERNAPESCA) mantuvo durante los meses de abril y mayo de 2025 alertas sanitarias en sectores de las comunas de Quellón, Dalcahue y Chonchi, paralizando temporalmente cosechas y generando pérdidas estimadas en más de USD 4,5 millones solo en esas semanas, de acuerdo con estimaciones del gremio local.

Monitoreo en tiempo real: la respuesta tecnológica

Frente a este escenario, una de las apuestas más concretas del sector es la implementación de sistemas de monitoreo oceanográfico en tiempo real. La Universidad Austral de Chile (UACh), a través de su Instituto de Acuicultura en Puerto Montt, lidera desde 2023 un proyecto financiado por CORFO que busca integrar boyas sensoriales con modelos predictivos de circulación de agua para anticipar episodios de FAN con hasta 72 horas de anticipación. A 2025, el piloto opera en tres polígonos acuícolas del sector noreste de Chiloé y los resultados preliminares muestran una precisión de alerta superior al 78%, lo que representa un avance significativo respecto a los protocolos reactivos vigentes.

Paralelamente, startups regionales como AquaSense y BioMonitor Chiloé han levantado capital semilla a través del programa Startup Ciencia de CORFO para desarrollar soluciones de bajo costo que puedan escalar a pequeños y medianos mitilicultores, quienes históricamente han quedado fuera del acceso a tecnología de monitoreo avanzado.

Normativa y trazabilidad: el nuevo exigente del mercado europeo

A partir de enero de 2025, la Unión Europea reforzó los controles de trazabilidad para bivalvos importados en el marco del Reglamento (UE) 2024/1009, exigiendo documentación sanitaria de toda la cadena desde el centro de cultivo hasta el punto de exportación. Este cambio normativo obliga a las empresas chilenas a digitalizar procesos que en muchos casos aún se gestionan de forma manual.

La Asociación de Mitilicultores de Chile (AmiChile) está trabajando junto al Ministerio de Economía y al Servicio Nacional de Aduanas en la implementación de una plataforma nacional de trazabilidad acuícola que permita cumplir con este estándar de forma estandarizada. No obstante, desde el sector se advierte que el calendario es ajustado y que las empresas pequeñas —que representan cerca del 40% de los concesionarios activos en Los Lagos— necesitarán apoyo técnico y financiero para adaptarse antes que sus envíos sean frenados en puertos europeos.

Oportunidades para emprendedores y proveedores de la cadena

Más allá de los desafíos, el momento actual abre ventanas concretas para emprendedores y proveedores regionales. La creciente demanda por valor agregado en origen impulsa oportunidades en áreas como desarrollo de productos funcionales a base de mejillón, biofertilizantes derivados de subproductos del proceso, bioplásticos a partir de valvas y soluciones de logística fría especializada para mercados distantes.

INDAP ha ampliado en 2025 su línea de financiamiento para organizaciones de pequeños acuicultores de las provincias de Chiloé y Llanquihue, con montos de hasta $35 millones de pesos por organización destinados a infraestructura de proceso y certificación sanitaria. A ello se suman los fondos de CORFO Regiones orientados a proyectos de innovación en la cadena acuícola, cuya próxima convocatoria está programada para el tercer trimestre de 2025.

Una industria que no puede crecer sola: conclusión territorial

La mitilicultura de la Región de Los Lagos es un activo estratégico del desarrollo productivo regional, pero su sostenibilidad en el mediano plazo depende de que los distintos actores —empresas exportadoras, pequeños concesionarios, universidades, organismos públicos y emprendedores— logren articularse con mayor eficacia que en el pasado. La tecnología está disponible. Los fondos existen. Los mercados demandan. El eslabón más débil sigue siendo la coordinación y la velocidad de adopción, especialmente en el segmento de productores de menor escala que operan en comunas costeras de Chiloé con escasa conectividad y acceso a servicios de desarrollo empresarial.

En Estación Emprende seguiremos monitoreando los movimientos del sector acuícola regional, convencidos de que la información oportuna y de calidad es también un insumo productivo para quienes trabajan en y para el mar de Los Lagos.

Preguntas clave para reflexionar

• ¿Está tu empresa o emprendimiento preparado para cumplir con los nuevos estándares de trazabilidad exigidos por la Unión Europea desde enero de 2025?
• ¿Qué tan expuesto está tu negocio al riesgo de las FAN y cuentas con un protocolo de contingencia documentado?
• ¿Estás aprovechando los fondos de CORFO e INDAP disponibles en 2025 para innovación y mejora productiva en la cadena acuícola?
• ¿Tu empresa ha explorado líneas de valor agregado —productos funcionales, subproductos, formatos diferenciados— para reducir dependencia de commodities de bajo margen?
• ¿Conoces los proyectos de I+D que la UACh y otras universidades regionales están desarrollando y que podrían beneficiar directamente tu operación?