La mitilicultura en Los Lagos: una industria estratégica bajo presión

La mitilicultura en la Región de Los Lagos representa uno de los pilares productivos más relevantes del sur de Chile. Con más de 3.200 centros de cultivo activos registrados ante SERNAPESCA al cierre de 2024, y exportaciones de mejillón que superaron las 85.000 toneladas en peso neto durante 2023 según cifras de ProChile, la industria consolida a Los Lagos como la principal zona productora de Mytilus chilensis a nivel mundial. Sin embargo, el año 2025 arranca con señales mixtas: mientras los mercados europeos y asiáticos mantienen su apetito por el mejillón chileno, las alertas por marea roja (FAN – Floraciones Algales Nocivas) y el aumento sostenido en los costos operativos ponen a prueba la resiliencia del sector.

Marea roja en Los Lagos: el enemigo silencioso de la mitilicultura

Durante el primer trimestre de 2025, el Sernapesca mantuvo vedas sanitarias activas en zonas clave de las provincias de Chiloé y Palena, afectando directamente la capacidad de cosecha de cientos de pequeños y medianos mitilicultores. Las vedas por presencia de Alexandrium catenella —principal dinoflagelado responsable del Veneno Paralítico de los Mariscos (VPM)— se han extendido con mayor frecuencia e intensidad en los últimos tres años, un fenómeno que investigadores de la Universidad Austral de Chile (UACh) asocian al calentamiento de las masas de agua superficial en el mar interior de Chiloé.

Para los productores, cada día de veda implica costos directos: el mejillón en talla comercial no puede ser cosechado ni procesado, generando pérdidas en biomasa y presión financiera sobre las empresas. Según estimaciones del Programa de Mitilicultura de CORFO Los Lagos, las pérdidas productivas asociadas a eventos FAN durante 2024 bordearon los USD 18 millones en la región, cifra que refleja la urgencia de desarrollar sistemas de alerta temprana más precisos y accesibles para el sector.

Sistemas de monitoreo: la tecnología como respuesta regional

Frente a este escenario, han surgido iniciativas concretas desde el ecosistema de innovación regional. La startup AlgaSense, incubada en el Centro de Emprendimiento e Innovación de la UACh en Puerto Montt, desarrolla sensores IoT de bajo costo para monitoreo en tiempo real de parámetros de calidad del agua —temperatura, clorofila, pH y oxígeno disuelto— que permiten anticipar condiciones favorables para el desarrollo de floraciones nocivas. Con financiamiento de un proyecto CORFO Línea I+D Aplicada, el equipo espera tener su primera red piloto operativa en el sector de Dalcahue durante el segundo semestre de 2025.

Esta clase de soluciones tecnológicas, desarrolladas desde y para el territorio, representan exactamente el tipo de transferencia tecnológica que el ecosistema productivo regional necesita: pertinente, escalable y conectada con la realidad de los mitilicultores de Los Lagos.

Mercados de exportación: Europa lidera, Asia emerge

A pesar de las dificultades sanitarias internas, el mejillón chileno mantiene una posición competitiva sólida en los mercados internacionales. España, Francia e Italia siguen siendo los principales destinos del mejillón en conserva y congelado producido en Los Lagos, concentrando cerca del 62% del volumen exportado según datos de ProChile correspondientes a 2024. Sin embargo, la tendencia más relevante para los próximos años es la apertura de mercados asiáticos: Japón, Corea del Sur y, más recientemente, Vietnam han mostrado un interés creciente por el mejillón chileno como proteína de bajo costo y alta sostenibilidad.

Este posicionamiento no es casual. La industria mitilicultora de Los Lagos ha avanzado en la adopción de certificaciones internacionales como ASC (Aquaculture Stewardship Council) y BAP (Best Aquaculture Practices), que son cada vez más exigidas por los retailers europeos y asiáticos. Hoy, alrededor del 35% de los centros de mayor escala en la región cuentan con alguna certificación de sostenibilidad, pero el desafío es extender esta cultura certificadora hacia los productores medianos y pequeños, que representan más del 70% de los mitilicultores activos en el territorio.

El rol de INDAP y CORFO en la resiliencia del sector

La estructura productiva de la mitilicultura en Los Lagos es marcadamente heterogénea: conviven grandes empresas exportadoras con cientos de pequeños productores familiares que dependen casi exclusivamente de esta actividad. Para este segmento, los instrumentos de fomento del Estado son decisivos.

INDAP Los Lagos mantiene activos durante 2025 programas de asistencia técnica y créditos de operación específicos para mitilicultores, con énfasis en la adopción de buenas prácticas acuícolas y el acceso a certificaciones sanitarias. Por su parte, CORFO Región de Los Lagos ha impulsado convocatorias específicas dentro del marco del Programa Estratégico Regional Acuicultura, financiando proyectos de innovación en sistemas de cultivo, alimentación complementaria y trazabilidad de producto.

No obstante, desde las organizaciones de productores como AmiChile (Asociación de Mitilicultores de Chile) se insiste en la necesidad de agilizar los mecanismos de compensación ante eventos sanitarios no controlables —como las mareas rojas— y de fortalecer la infraestructura de frío y logística en zonas insulares y de difícil acceso, donde los costos de transporte erosionan significativamente los márgenes de los productores más pequeños.

Perspectiva territorial: Los Lagos ante una encrucijada productiva

La mitilicultura en la Región de Los Lagos se encuentra en una encrucijada que, bien gestionada, puede convertirse en una oportunidad de salto cualitativo para la industria regional. La combinación de presión ambiental creciente, exigencias de mercado más sofisticadas y el surgimiento de soluciones tecnológicas locales configura un momento bisagra para el sector.

La clave estará en la capacidad del ecosistema regional —productores, universidades, instituciones de fomento y empresas tecnológicas— para articular respuestas integradas. Apostar por la trazabilidad digital, los sistemas de monitoreo predictivo y la certificación de sostenibilidad no es solo una exigencia del mercado externo: es la condición para que la mitilicultura siga siendo una fuente de empleo digno y desarrollo territorial para las comunidades costeras de Los Lagos en los próximos veinte años.

El mejillón chileno tiene todas las condiciones para liderar la acuicultura sostenible a nivel mundial. La pregunta es si el territorio sabrá construir a tiempo las condiciones para que eso ocurra.

Preguntas clave para reflexionar

• ¿Está su empresa o emprendimiento incorporando sistemas de monitoreo tecnológico para anticipar eventos de marea roja, o sigue dependiendo exclusivamente de las alertas oficiales de SERNAPESCA?
• ¿Conoce las líneas de financiamiento vigentes de CORFO e INDAP Los Lagos específicas para mitilicultores en 2025 y ha evaluado su pertinencia para su operación?
• ¿Su producción cuenta con alguna certificación internacional (ASC, BAP u otra) que le permita acceder a mercados de mayor valor en Europa o Asia?
• ¿Cómo está preparando su negocio para responder a las exigencias de trazabilidad y sostenibilidad que los mercados internacionales proyectan como estándar mínimo para 2027?
• ¿Existe en su territorio una red de colaboración activa entre productores, centros de investigación y proveedores tecnológicos, o cada actor sigue enfrentando los desafíos de manera aislada?