La mitilicultura en Los Lagos: pilar exportador bajo presión

La mitilicultura en la Región de Los Lagos atraviesa un momento bisagra en 2025. Con más de 320 centros de cultivo activos entre las provincias de Llanquihue, Chiloé y Palena, el sector del mejillón (Mytilus chilensis) genera aproximadamente 85.000 toneladas anuales de producto, posicionando a Chile como el segundo exportador mundial de mejillón después de Nueva Zelanda, según cifras de SERNAPESCA actualizadas al primer trimestre de este año. Sin embargo, la combinación de episodios de marea roja de mayor frecuencia, presión regulatoria creciente y volatilidad en los mercados de destino obliga a los actores del territorio a replantear sus estrategias productivas con urgencia.

Floraciones algales nocivas: el factor que no cede

Las Floraciones Algales Nocivas (FAN), conocidas regionalmente como marea roja, siguen siendo el principal factor disruptivo para la mitilicultura chilota y de toda la región. Durante el verano austral 2024-2025, la Subsecretaría de Pesca y Acuicultura (Subpesca) activó alertas sanitarias en al menos 14 sectores del archipiélago de Chiloé, afectando la cosecha y el despacho de cargamentos hacia la Unión Europea y Estados Unidos, los dos destinos que concentran el 68% de las exportaciones regionales del bivalvo.

El impacto económico no es menor. Según estimaciones de la Asociación de Mitilicultores de Chile (AmiChile), cada semana de veda sanitaria implica pérdidas directas de entre USD 1,2 y USD 1,8 millones para el conjunto de productores de la región, sin considerar los efectos indirectos en plantas procesadoras de Puerto Montt, Calbuco y Castro. Los pequeños y medianos productores —que representan el 73% del padrón registrado ante SERNAPESCA— son quienes absorben el mayor impacto, pues carecen de capital de trabajo para sostener operaciones durante períodos extendidos de cierre.

Monitoreo en tiempo real: la respuesta tecnológica regional

Frente a este escenario, iniciativas de base tecnológica comienzan a tomar forma en el territorio. La Universidad Austral de Chile (UACh), a través de su Instituto de Acuicultura sede Puerto Montt, desarrolla desde 2023 un sistema de monitoreo oceanográfico distribuido que combina boyas sensoriales con modelos predictivos de dispersión de Alexandrium catenella, la microalga toxigénica más frecuente en la región. El proyecto, cofinanciado por CORFO mediante el programa Investigación y Desarrollo Tecnológico Empresarial, busca anticipar en 48 a 72 horas la probabilidad de floración, dando tiempo operativo a los mitilicultores para adelantar cosechas o activar protocolos de contingencia.

Aunque la tecnología aún está en fase piloto, los resultados preliminares en el sector de Quellón son alentadores: en tres de cuatro eventos FAN detectados entre junio y septiembre de 2024, el modelo entregó alertas tempranas efectivas. La escalabilidad del sistema a todo el litoral regional dependerá de financiamiento adicional y de la articulación con el Servicio Nacional de Pesca y Acuicultura (SERNAPESCA) para integrar los datos al sistema oficial de vigilancia sanitaria.

Regulación y trazabilidad: el estándar europeo como exigencia

El acceso al mercado europeo —que en 2024 absorbió cerca de 42.000 toneladas de mejillón chileno procesado— está condicionado por el cumplimiento de normativas sanitarias cada vez más exigentes. El Reglamento (UE) 2017/625 sobre controles oficiales y las directrices de la European Food Safety Authority (EFSA) imponen a los exportadores chilenos estándares de trazabilidad que van desde el origen del lote en la batea hasta la planta de proceso, pasando por la cadena de frío y la documentación sanitaria emitida por SERNAPESCA.

En este contexto, el Decreto Supremo N°49 (DS49) del Ministerio de Economía, que regula las concesiones de acuicultura en Chile, ha sido objeto de debate en la región durante el último año. Productores organizados en torno a AmiChile han solicitado modificaciones que agilicen la renovación de concesiones y simplifiquen los requisitos de los Programas de Manejo Ambiental (PMA), argumentando que la burocracia actual desincentiva la inversión en mejoras tecnológicas. La Superintendencia del Medio Ambiente (SMA), por su parte, mantiene que el marco regulatorio vigente es necesario para garantizar la sostenibilidad del ecosistema marino del que depende toda la cadena productiva.

Oportunidades: diversificación y mercados emergentes

Pese al contexto complejo, el sector mitilicultor de Los Lagos proyecta oportunidades concretas para el mediano plazo. ProChile identificó en su reporte de inteligencia comercial de diciembre de 2024 una demanda creciente de mejillón chileno en mercados asiáticos, particularmente en Japón, Corea del Sur y Vietnam, donde el consumo de bivalvos procesados (congelados IQF, ahumados y en conserva) creció un 11% interanual. Para los productores de la región, esto abre una ventana de diversificación que reduce la dependencia del mercado europeo.

Asimismo, el Programa de Desarrollo de Proveedores (PDP) de CORFO ha financiado en 2024 tres proyectos de innovación en valor agregado para el mejillón chilote: desarrollo de harinas y hidrolizados proteicos para la industria de alimentos funcionales, packaging activo para conservación en fresco y formulación de suplementos nutricionales. Estas iniciativas, lideradas por empresas medianas de Puerto Montt en alianza con la Universidad de Los Lagos, apuntan a capturar mayor valor por kilogramo exportado, una necesidad estratégica en un sector donde el precio promedio FOB del mejillón congelado se ha mantenido estancado entre USD 2,8 y USD 3,2 por kilogramo durante los últimos tres años.

Perspectiva territorial: Los Lagos ante un momento de definición

La Región de Los Lagos concentra más del 90% de la producción mitilicultora de Chile, lo que convierte a este sector en un componente estructural de la economía regional. Las decisiones que se tomen en los próximos 24 meses —en materia de inversión tecnológica, adaptación regulatoria y diversificación de mercados— definirán si la mitilicultura regional consolida su posición competitiva global o pierde terreno frente a competidores neozelandeses, españoles y chinos.

La clave estará en la articulación efectiva entre el sector productivo, el Estado —a través de CORFO, SERNAPESCA y Subpesca— y la academia regional. Experiencias como el proyecto de monitoreo de la UACh o los PDP de CORFO demuestran que el ecosistema de innovación en Los Lagos tiene capacidad de respuesta. El desafío es escalar esas respuestas a la velocidad que el mercado global exige, sin descuidar la sostenibilidad del recurso marino que hace posible toda la cadena.

Preguntas clave para reflexionar

• ¿Está su empresa mitilicultora incorporando tecnología de monitoreo ambiental para anticipar eventos FAN, o aún depende exclusivamente de las alertas oficiales de SERNAPESCA?
• ¿Conoce los requisitos actuales del mercado asiático para el mejillón chileno procesado y ha evaluado la diversificación hacia esos destinos?
• ¿Cómo está preparando su operación para cumplir con los estándares de trazabilidad exigidos por la Unión Europea ante una eventual auditoría del sistema de control oficial?
• ¿Ha explorado los instrumentos de CORFO disponibles en 2025 para financiar innovación en valor agregado dentro de la cadena mitilicultora regional?
• ¿Qué rol está jugando su empresa u organización en la articulación entre el sector productivo y la academia para generar soluciones tecnológicas con base territorial en Los Lagos?