La mitilicultura regional ante un año decisivo

La mitilicultura en la Región de Los Lagos atraviesa un momento de inflexión. Con más de 85.000 toneladas de mejillón chileno (Mytilus chilensis) cosechadas durante 2024 según cifras de SERNAPESCA, la industria consolida su posición como el segundo sector acuícola más relevante de Chile, solo por detrás del salmón. Sin embargo, el año 2025 llega cargado de tensiones: episodios recurrentes de marea roja, presión regulatoria creciente y la necesidad urgente de adoptar tecnología para mantenerse competitivos en mercados europeos y asiáticos que elevan constantemente sus estándares de inocuidad.

Para los productores, procesadores y emprendedores vinculados a la cadena del mejillón en las provincias de Llanquihue, Chiloé y Palena, comprender la magnitud de estos desafíos —y las oportunidades que traen aparejados— es una condición indispensable para tomar decisiones estratégicas en los próximos meses.

Marea roja: el factor de riesgo estructural que no cede

El fenómeno de Floraciones Algales Nocivas (FAN), conocido popularmente como marea roja, sigue siendo el principal factor de riesgo estructural para la mitilicultura en Los Lagos. Durante el primer trimestre de 2025, el SERNAPESCA mantuvo vedas sanitarias activas en sectores críticos del archipiélago de Chiloé, afectando la cosecha y generando pérdidas estimadas que, en años similares, han superado los USD 20 millones en valor FOB no exportado.

El problema tiene una dimensión técnica precisa: la acumulación de toxinas paralizantes de moluscos (TPM) y diarreicas (TDM) en los tejidos del Mytilus chilensis obliga a suspender la extracción hasta que los índices vuelven a rangos seguros, conforme a los protocolos del Programa de Sanidad de Moluscos Bivalvos (PSMB) que ejecuta el Sernapesca en coordinación con el Instituto de Fomento Pesquero (IFOP).

Tecnología de monitoreo como respuesta sectorial

Frente a esta realidad, algunas empresas medianas y startups de base tecnológica han comenzado a instalar sistemas de monitoreo en tiempo real mediante sensores IoT anclados en las líneas de cultivo. Estas plataformas permiten medir parámetros como temperatura superficial del mar, salinidad, oxígeno disuelto y concentración de clorofila, variables que anticipan con mayor precisión la aparición de floraciones. Iniciativas apoyadas por CORFO a través del programa Capital Semilla Expande han financiado prototipos de este tipo en la zona de Castro y Dalcahue durante 2024, abriendo una línea de innovación que merece escalar regionalmente en 2025.

Regulación y trazabilidad: el nuevo estándar que exige Europa

El mercado europeo absorbe aproximadamente el 60% de las exportaciones de mejillón chileno, con España, Francia e Italia como destinos principales según datos de ProChile. Sin embargo, la implementación progresiva del Reglamento Europeo de Deforestación (EUDR) y el endurecimiento de los controles del sistema RASFF (Rapid Alert System for Food and Feed) elevan la vara de la trazabilidad y la sostenibilidad ambiental para todos los exportadores.

En términos prácticos, esto significa que los centros de cultivo y plantas de proceso de Los Lagos deben avanzar hacia sistemas de trazabilidad lote a lote, certificaciones como ASC (Aquaculture Stewardship Council) y documentación ambiental que acredite el origen y las condiciones de producción. La Asociación de Mitilicultores de Chile (AmiChile) ha identificado esta transición como prioritaria en su agenda 2025-2026, promoviendo talleres de capacitación en alianza con universidades regionales como la Universidad de Los Lagos (ULagos) y la Universidad Austral de Chile (UACh), que cuentan con programas de investigación aplicada en acuicultura sustentable.

Innovación y valor agregado: la apuesta por diferenciarse

Más allá de la exportación de mejillón cocido congelado —producto que representa la mayor parte del volumen embarcado—, existe un espacio significativo para el desarrollo de productos de mayor valor agregado que permitan capturar mejores precios y reducir la vulnerabilidad ante oscilaciones del mercado commodity.

En esta línea, emprendimientos de la región están explorando líneas como conservas artesanales con denominación de origen, harinas y aceites funcionales a partir de subproductos del proceso industrial, y formulaciones nutracéuticas basadas en el alto contenido de omega-3 y proteínas del mejillón chileno. El programa FNDR de Innovación del Gobierno Regional de Los Lagos, junto a instrumentos de CORFO como el Subsidio Semilla de Asignación por Concurso (SSAC), han financiado en los últimos dos años al menos 12 proyectos piloto vinculados a esta cadena de valor en las provincias de Chiloé y Llanquihue.

La academia juega aquí un rol articulador clave. El Centro i~mar de la ULagos en Puerto Montt ha desarrollado investigaciones sobre bioprocesamiento de residuos de mitílidos, transfiriendo conocimiento técnico a pequeños y medianos productores que de otro modo no tendrían acceso a esa información.

El eslabón del pequeño productor: una deuda pendiente

No es posible hablar de la mitilicultura regional sin reconocer que una parte sustancial del sector está compuesta por pequeños productores artesanales e indígenas, muchos de ellos comunidades mapuche-williche en Chiloé y las islas interiores, para quienes el acceso a financiamiento, asistencia técnica y mercados formales sigue siendo limitado. INDAP, a través de su Programa de Desarrollo Local (PRODESAL) y el Area de Fomento Acuícola, atiende a parte de este segmento, pero los propios técnicos reconocen que la brecha entre la pequeña mitilicultura de subsistencia y la industria exportadora es aún amplia.

La conectividad territorial —o su ausencia— agrava el problema. Centros de cultivo en islas sin acceso por carretera enfrentan costos logísticos que erosionan márgenes y dificultan el cumplimiento de protocolos de frío requeridos para exportación directa. Es un desafío que involucra no solo al sector privado, sino a la política pública regional en materia de infraestructura y fomento productivo.

Perspectiva territorial: Los Lagos ante una ventana de oportunidad

La Región de Los Lagos posee condiciones oceanográficas únicas en el mundo para el cultivo de mejillón: aguas frías, alta productividad primaria y una geografía de fiordos y canales que protege los centros de cultivo de la dinámica oceánica abierta. Esa ventaja comparativa natural no se puede dar por garantizada en un escenario de cambio climático que altera la temperatura del mar y la frecuencia de eventos FAN, pero sí puede ser potenciada con inversión en ciencia, tecnología y gobernanza sectorial.

El desafío para 2025 es construir una industria mitilicultora regional que sea al mismo tiempo competitiva en los mercados internacionales, resiliente frente a las amenazas ambientales y justa con los actores más vulnerables de la cadena. Eso requiere que empresas, instituciones públicas, academia y comunidades productoras dialoguen con más fluidez que en el pasado. La oportunidad está sobre la mesa —o mejor dicho, sobre las líneas de cultivo— y el tiempo para actuar es ahora.

Preguntas clave para reflexionar

• ¿Está tu empresa o emprendimiento preparado para cumplir los nuevos estándares de trazabilidad que exige el mercado europeo a partir de 2025?
• ¿Conoces los instrumentos de CORFO e INDAP disponibles para financiar tecnología de monitoreo o certificaciones de sustentabilidad en tu centro de cultivo?
• ¿Cómo está afectando la frecuencia de episodios de marea roja a tu planificación productiva y financiera de corto plazo?
• ¿Qué oportunidades de valor agregado ves en tu eslabón de la cadena del mejillón que aún no han sido exploradas en la región?
• ¿Existe suficiente vinculación entre tu organización y las universidades regionales que investigan acuicultura sustentable en Los Lagos?