La mitilicultura regional ante un año de prueba: entre la marea roja y los mercados globales

La Region de Los Lagos concentra más del 85% de la producción nacional de mejillón chileno (Mytilus chilensis), consolidándose como el corazón de la mitilicultura en el hemisferio sur. Sin embargo, el cierre del año 2024 y los primeros meses de 2025 han puesto a prueba la resiliencia de esta industria: episodios de Floraciones Algales Nocivas (FAN) en el mar interior de Chiloé, presiones regulatorias crecientes y una demanda europea que exige trazabilidad como condición de acceso. Para los cerca de 3.200 mitilicultores registrados ante SERNAPESCA en la región —la mayoría operando como micro y pequeños productores—, el escenario 2025 no es sencillo, pero tampoco carece de oportunidades reales.

Mareas rojas en el mar interior: impacto productivo y económico

Durante el verano austral 2024-2025, la Autoridad Sanitaria Regional y el Servicio Nacional de Pesca y Acuicultura (SERNAPESCA) activaron alertas por presencia de Alexandrium catenella y Dinophysis acuminata en sectores del Archipiélago de Chiloé y el Seno del Reloncaví, dos de las zonas de mayor densidad concesional del país. Estas especies producen toxinas paralizantes y diarreicas en los bivalvos, lo que obliga a decretar vedas sanitarias que pueden extenderse desde semanas hasta meses.

Según datos del Instituto de Fomento Pesquero (IFOP), durante 2024 se registraron más de 60 alertas activas acumuladas en distintos puntos del litoral de Los Lagos, afectando directamente el calendario de cosecha de cientos de concesionarios. Para un productor mediano con una línea de cultivo de 200 metros, cada semana de veda puede representar una pérdida de entre $800.000 y $1.500.000 en ingresos brutos, según estimaciones del gremio Asociación de Mitilicultores de Chile (AmiChile).

El rol del monitoreo temprano y la tecnología de alerta

Frente a este escenario, la Universidad Austral de Chile (UACh) y el Centro i~mar de la Universidad de Los Lagos trabajan en el desarrollo de sistemas de modelamiento predictivo de FAN basados en temperatura superficial del mar, salinidad y corrientes oceánicas. El objetivo es anticipar con 72 a 96 horas de anticipación la llegada de floraciones nocivas a zonas concesionales, permitiendo que los productores aceleren o posterguen cosechas de manera informada. Este tipo de transferencia tecnológica desde la academia hacia el sector productivo es precisamente el tipo de innovación que necesita la mitilicultura regional para profesionalizar su gestión de riesgos.

Exportaciones de mejillón: Chile busca consolidarse en Europa y Asia

A pesar de los episodios sanitarios, las exportaciones chilenas de mejillón procesado cerraron 2024 con un volumen aproximado de 62.000 toneladas, según cifras preliminares de ProChile, con destino principal a España, Francia, Italia y, en crecimiento, Japón y Corea del Sur. El valor FOB superó los USD 180 millones, consolidando al mejillón como el segundo producto acuícola de exportación del país, solo después del salmón del Atlántico.

No obstante, el acceso al mercado europeo enfrenta exigencias crecientes. El Reglamento de la Unión Europea sobre Deforestación (EUDR) y la actualización de los protocolos del Sistema de Análisis de Peligros y Puntos Críticos de Control (HACCP) que exige la Comisión Europea obligan a los procesadores regionales a demostrar trazabilidad completa desde la concesión hasta el producto final. Para las plantas procesadoras de Puerto Montt, Calbuco y Castro, esto implica inversiones en digitalización de registros, certificaciones internacionales y capacitación del personal.

Aquí emerge una oportunidad concreta para el ecosistema emprendedor de la región: el desarrollo de soluciones SaaS de trazabilidad acuícola adaptadas a la realidad del pequeño y mediano mitilicultor chilote, una brecha que todavía ninguna startup regional ha cubierto de manera masiva.

Regulación y ordenamiento territorial: el DS49 como marco vigente

El Decreto Supremo N°49 (DS49) del Ministerio de Economía, que regula las concesiones de acuicultura en Chile, sigue siendo el marco normativo central para la actividad. En Los Lagos, la Subsecretaría de Pesca y Acuicultura mantiene procesos abiertos de revisión de concesiones en áreas de manejo, lo que genera incertidumbre en algunos productores respecto de la renovación de sus títulos habilitantes.

Paralelamente, la Superintendencia del Medio Ambiente (SMA) ha intensificado la fiscalización de planes de manejo ambiental en concesiones acuícolas, especialmente en lo relativo a disposición de residuos orgánicos y uso de insumos veterinarios. Si bien estos controles son necesarios para la sustentabilidad del ecosistema del mar interior, los productores más pequeños señalan que la carga administrativa asociada puede convertirse en una barrera de entrada que beneficia a los grandes operadores en detrimento de los mitilicultores familiares.

Innovación y financiamiento: qué oportunidades existen para el sector hoy

En el plano del fomento productivo, CORFO Los Lagos mantiene activas líneas de financiamiento orientadas a la modernización de la acuicultura de pequeña escala, incluyendo el Programa de Desarrollo de Proveedores (PDP) y los instrumentos de Capital Semilla Emprende para iniciativas de base tecnológica vinculadas a la acuicultura. A esto se suma el trabajo de INDAP con pequeños acuicultores a través del programa PRODESAL, que en varios municipios de Chiloé incorpora a mitilicultores como beneficiarios de asistencia técnica.

Una señal positiva para el sector fue la adjudicación en enero de 2025 de un proyecto FONDEF IDeA liderado por la Universidad de Los Lagos en conjunto con AmiChile, orientado al desarrollo de tecnologías de depuración acelerada de bivalvos contaminados por FAN, lo que podría reducir significativamente los tiempos de veda en el futuro. Este proyecto, con una ejecución proyectada de tres años y un presupuesto de $420 millones, representa exactamente el tipo de articulación academia-industria-territorio que puede transformar la competitividad estructural de la mitilicultura regional.

Conclusión: Los Lagos ante la encrucijada de una industria que debe crecer hacia adentro

La mitilicultura de la Región de Los Lagos tiene todos los activos para seguir siendo referente mundial: condiciones oceanográficas privilegiadas, conocimiento acumulado en decenas de comunidades costeras, acceso a mercados globales y un ecosistema institucional —aunque perfectible— que incluye universidades, agencias de fomento y gremios activos. El desafío no es la falta de potencial, sino la capacidad de articular ese potencial de manera más equitativa y tecnológicamente sofisticada.

La profesionalización de los productores más pequeños, la adopción de tecnologías de monitoreo y trazabilidad, y una regulación que combine exigencia ambiental con viabilidad económica para el productor familiar, serán las claves que definan si la mitilicultura de Los Lagos llega al 2030 más fuerte o más fragmentada. En esa ecuación, el rol de los emprendedores y las soluciones innovadoras del territorio será determinante.

Preguntas clave para reflexionar

• ¿Está tu operación mitilicultora preparada para cumplir con los nuevos estándares de trazabilidad que exige el mercado europeo a partir de 2025?
• ¿Conoces los instrumentos de CORFO e INDAP disponibles en Los Lagos para modernizar tu concesión acuícola este año?
• ¿De qué manera los sistemas de alerta temprana de mareas rojas podrían cambiar la planificación de tu calendario de cosecha?
• ¿Existe en tu sector colaboración real con centros universitarios regionales para adoptar innovaciones productivas o seguís resolviendo los problemas de forma aislada?
• ¿La regulación del DS49 y la fiscalización de la SMA son percibidas en tu comunidad como herramientas de desarrollo o como obstáculos burocráticos?