La mitilicultura en Los Lagos: motor acuícola bajo presión

La mitilicultura en la Región de Los Lagos consolida su posición como uno de los sectores acuícolas más relevantes de Chile, pero el año 2025 llega cargado de señales mixtas. Según datos de SERNAPESCA, la región concentra más del 85% de la producción nacional de mejillón (Mytilus chilensis), con cerca de 280.000 toneladas cosechadas durante 2024. Sin embargo, episodios recurrentes de Floraciones Algales Nocivas (FAN), ajustes regulatorios y la presión de los mercados internacionales obligan al sector a acelerar su transformación. Para los productores, técnicos y empresarios de Los Lagos, entender este escenario no es opcional: es condición de sobrevivencia.

Mareas rojas y FAN: el desafío sanitario que no cede

Durante el primer trimestre de 2025, el Servicio Nacional de Pesca y Acuicultura (SERNAPESCA) mantuvo vedas sanitarias activas en sectores clave de las comunas de Calbuco, Maullín y Quellón, afectando la operación de decenas de centros de cultivo. La presencia de Alexandrium catenella, principal organismo productor de toxina paralizante de mariscos (VPM), obligó a paralizar cosechas programadas y generar pérdidas que el sector aún cuantifica.

Este fenómeno no es nuevo, pero su frecuencia e intensidad preocupan. El cambio climático ha alterado los patrones de surgencia y temperatura superficial del mar en el Seno de Reloncaví y el archipiélago de Chiloé, generando condiciones más favorables para el desarrollo de FAN. El Instituto de Fomento Pesquero (IFOP) ha intensificado su red de monitoreo, con más de 40 puntos de muestreo activos en Los Lagos, pero los productores exigen respuestas más rápidas y sistemas de alerta temprana con mayor resolución espacial.

Tecnología como respuesta al monitoreo sanitario

Frente a este escenario, algunas empresas regionales han comenzado a integrar soluciones de monitoreo remoto en tiempo real. Boyas instrumentadas con sensores de clorofila, temperatura y salinidad, conectadas a plataformas de análisis de datos en la nube, permiten anticipar condiciones de riesgo. Startups vinculadas al ecosistema de CORFO Los Lagos y a la incubadora de la Universidad Austral de Chile (UACh) trabajan en prototipos adaptados a las condiciones del mar interior chilote. La transferencia efectiva de estas tecnologías al pequeño y mediano mitilicultor sigue siendo, sin embargo, el nudo crítico pendiente.

Exportaciones de mejillón: mercados exigentes, certificaciones obligatorias

A pesar de las restricciones sanitarias, las exportaciones de mejillón chileno cerraron 2024 con cifras positivas. Según datos de ProChile, el valor FOB exportado superó los USD 320 millones, con España, Francia y Estados Unidos como principales destinos. El mejillón congelado y en conserva lidera los envíos, aunque el mejillón vivo refrigerado gana espacio en nichos gourmet europeos.

El acceso a estos mercados, sin embargo, impone exigencias crecientes. La Unión Europea mantiene controles estrictos bajo el Reglamento (CE) 854/2004 y sus actualizaciones, exigiendo trazabilidad completa desde el centro de cultivo hasta el punto de venta. En este contexto, la certificación ASC (Aquaculture Stewardship Council) se ha convertido en un diferenciador competitivo real: las empresas certificadas de Los Lagos acceden a canales de distribución premium con mejores precios. Al cierre de 2024, menos del 15% de los centros de cultivo mitilícola de la región contaba con esta certificación, lo que representa tanto un déficit como una oportunidad concreta para quienes estén dispuestos a invertir en el proceso.

Marco regulatorio: el DS49 y la nueva institucionalidad acuícola

El sector mitilícola opera bajo un marco regulatorio que no ha terminado de estabilizarse. El Decreto Supremo N°49 (DS49) del Ministerio de Economía, que establece medidas sanitarias y ambientales para la acuicultura, continúa generando debate entre los operadores de Los Lagos. Las exigencias de Planes de Manejo Ambiental y los límites a la densidad de cultivo buscan reducir el impacto sobre los fondos marinos, pero los productores más pequeños señalan que los costos de cumplimiento amenazan su viabilidad.

La Superintendencia del Medio Ambiente (SMA) ha incrementado las fiscalizaciones en la región durante 2024-2025, con especial foco en el manejo de residuos sólidos y la gestión de mortalidades masivas, un problema recurrente asociado a los eventos de FAN. Desde AmiChile (Asociación de Mitilicultores de Chile), gremio que agrupa a los principales actores del sector, se ha solicitado al Ministerio de Economía una mesa técnica para revisar los plazos de implementación y generar instrumentos de financiamiento que permitan a los medianos productores adaptarse sin comprometer su operación.

Innovación y futuro: ¿hacia dónde va la mitilicultura regional?

El horizonte de la mitilicultura en Los Lagos no está determinado solo por los desafíos inmediatos. Existen apuestas de mediano plazo que pueden redefinir el sector. La acuicultura de múltiples tróficos integrados (IMTA), que combina el cultivo de mejillón con algas y otras especies en sistemas que se nutren mutuamente, está siendo investigada por equipos de la Universidad de Los Lagos (ULAGOS) con financiamiento de FONDEF. Los primeros resultados en Chiloé muestran potencial para reducir la carga orgánica en los centros de cultivo y diversificar los ingresos del productor.

Asimismo, la economía circular aplicada a la mitilicultura abre oportunidades concretas: las valvas de mejillón, hoy un residuo de difícil gestión, tienen aplicaciones probadas en la industria de la construcción (como árido sostenible) y en la producción de carbonato de calcio para agricultura. Proyectos piloto vinculados a INDAP y a municipios como Puerto Montt y Calbuco buscan escalar estas soluciones en 2025.

Conclusión: Los Lagos apuesta por una mitilicultura más inteligente y resiliente

La mitilicultura en la Región de Los Lagos enfrenta un momento bisagra. Las presiones sanitarias, regulatorias y competitivas son reales y no deben minimizarse. Pero también lo son las oportunidades: mercados dispuestos a pagar por calidad certificada, tecnologías disponibles para mejorar el monitoreo y la gestión, y una institucionalidad —CORFO, IFOP, universidades regionales— que puede acompañar el proceso si los incentivos se articulan bien. El desafío para productores, técnicos y empresarios de Los Lagos es transitar desde una industria reactiva a una propositiva, capaz de anticipar riesgos y capturar valor en cada eslabón de la cadena.

• ¿Está tu empresa o centro de cultivo en condiciones de iniciar un proceso de certificación ASC en el corto plazo?
• ¿Cuánto conoces sobre los sistemas de monitoreo remoto disponibles para centros mitilícolas en Los Lagos y cómo podrías acceder a ellos?
• ¿Tu operación tiene un plan de contingencia documentado frente a eventos de FAN o cierre sanitario prolongado?
• ¿Has explorado las líneas de financiamiento de CORFO o INDAP orientadas a la innovación y adaptación ambiental en acuicultura?
• ¿Conoces el estado de cumplimiento de tu concesión acuícola respecto a las exigencias del DS49 y los planes de fiscalización de la SMA para 2025?