La mitilicultura en Los Lagos: motor silencioso de la economía regional

La mitilicultura en la Región de Los Lagos atraviesa uno de sus momentos más complejos y, paradójicamente, más prometedores. Con más de 4.200 centros de cultivo autorizados en el territorio regional según datos de SERNAPESCA actualizados a marzo de 2025, el mejillón chileno (Mytilus chilensis) se consolida como el segundo recurso acuícola más exportado del país, solo superado por el salmón. Sin embargo, la industria mitilicultora enfrenta una tormenta perfecta de factores que pone a prueba la resiliencia de productores, empresas medianas y pequeños emprendedores del borde costero de Chiloé, Palena y Llanquihue.

Entender este momento requiere mirar con honestidad tanto las cifras que ilusionan como los obstáculos que frenan el crecimiento sostenible del sector en nuestra región.

Exportaciones de mejillón: cifras que dan esperanza

De acuerdo con cifras publicadas por ProChile en su informe sectorial del primer trimestre de 2025, las exportaciones de mejillón chileno alcanzaron USD 198 millones en 2024, representando un crecimiento del 11% respecto al año anterior. España, Francia y Estados Unidos lideran los destinos, absorbiendo en conjunto cerca del 60% del volumen exportado en formatos de media concha, cocido congelado y conserva.

Para la Región de Los Lagos, estos números no son abstractos: aproximadamente el 78% de la producción nacional de mejillón se origina en las comunas de Dalcahue, Quemchi, Chonchi y Queilén, en el archipiélago de Chiloé. La cadena de valor involucra directamente a más de 12.000 personas entre mitilicultores artesanales, operarios de plantas de proceso y trabajadores logísticos, según estimaciones del Instituto de Fomento Pesquero (IFOP).

El mercado europeo y la presión por certificación

La Unión Europea, principal destino en valor, ha endurecido sus exigencias sanitarias y de trazabilidad bajo el marco del Reglamento (UE) 2021/1756, que amplía los controles sobre bivalvos importados. Esto obliga a las empresas exportadoras de Los Lagos a acelerar la implementación de sistemas de trazabilidad digital lote a lote, una inversión que pequeños productores difícilmente pueden asumir de forma individual. Aquí radica una oportunidad concreta para las asociaciones gremiales y para instrumentos de CORFO como el Programa de Difusión Tecnológica (PDT), que puede subsidiar hasta un 70% de proyectos de mejora tecnológica en pymes acuícolas.

Mareas rojas y Floraciones Algales Nocivas: el riesgo permanente

Si hay un factor que define la operación cotidiana de cualquier mitilicultor en Los Lagos, ese es el riesgo de Floraciones Algales Nocivas (FAN), conocidas popularmente como mareas rojas. Durante 2024, el Sistema de Monitoreo de Toxinas instalado por el SERNAPESCA en la zona decretó 47 vedas temporales en distintas áreas del Estuario de Reloncaví y el mar interior de Chiloé, afectando la cosecha programada de miles de toneladas de mejillón.

La toxina paralizante de mariscos (VPM) y la toxina diarreica (VDM) son los principales agentes detectados. Bajo el marco del DS 49/2015 del Ministerio de Economía, que regula la acuicultura de pequeña escala, los titulares de concesiones están obligados a suspender cosechas ante alertas oficiales, con las consecuentes pérdidas económicas que esto implica para familias que dependen del ingreso mitilicultor.

Sin embargo, instituciones académicas regionales como la Universidad Austral de Chile (UACh) y el Centro i~mar de la Universidad de Los Lagos trabajan en modelos predictivos de FAN que podrían anticipar eventos con hasta 72 horas de anticipación. Este tipo de innovación en I+D aplicada es exactamente el tipo de transferencia tecnológica que el sector necesita con urgencia.

Innovación y tecnología: ¿está lista la industria mitilicultora?

La modernización del sector mitilicultor en Los Lagos avanza, pero a una velocidad desigual. Las grandes empresas integradas —que controlan desde el cultivo hasta la exportación— han incorporado tecnologías de monitoreo ambiental en tiempo real, sistemas de gestión de concesiones bajo plataformas GIS y automatización parcial en plantas de proceso. Pero la mayoría de los productores de la región son mitilicultores de pequeña escala, con menos de 4 hectáreas concesionadas, balsas artesanales de madera y escaso acceso a financiamiento bancario tradicional.

En este contexto, el programa Asiva (Asistencia Técnica para la Acuicultura de Pequeña Escala) ejecutado por CORFO en alianza con INDAP ha logrado incorporar a más de 380 productores de Chiloé en procesos de formalización y mejora tecnológica durante el período 2022-2024. La meta para 2025 es ampliar la cobertura a la provincia de Palena, donde la conectividad y el aislamiento geográfico representan barreras adicionales.

El rol de las startups y la economía circular

Un fenómeno emergente que merece atención es el surgimiento de startups regionales enfocadas en la valorización de subproductos del mejillón. Las valvas o conchas, históricamente un problema de residuo para las plantas procesadoras de Puerto Montt y Castro, comienzan a convertirse en materia prima para producción de carbonato de calcio, biomateriales de construcción y sustratos agrícolas. Emprendimientos como los apoyados por el programa Startup Los Lagos de CORFO están explorando estas líneas, con potencial de crear nuevas cadenas de valor circulares dentro del territorio.

El desafío regulatorio: entre la SMA y la certeza jurídica

La relación entre la industria mitilicultora y el marco regulatorio es tensa pero necesaria. La Superintendencia del Medio Ambiente (SMA) ha intensificado sus fiscalizaciones en Los Lagos durante 2024, con foco en el cumplimiento de planes de manejo de residuos sólidos en concesiones acuícolas y en el control de ruido y tráfico marítimo en áreas de alto valor ecosistémico. Si bien estas acciones generan costos de cumplimiento para los productores, también fortalecen la imagen sanitaria del mejillón chileno ante los mercados europeos, que exigen trazabilidad ambiental cada vez con mayor rigor.

La actualización del Reglamento Ambiental para la Acuicultura (RAMA), en proceso de revisión por parte del Ministerio de Economía, genera expectativa e incertidumbre a partes iguales. Los productores piden certeza jurídica y plazos razonables para adaptarse; los organismos reguladores piden responsabilidad ambiental real. Encontrar ese equilibrio es la tarea política y técnica más urgente del sector en la región.

Conclusión: Los Lagos como laboratorio acuícola de Chile

La mitilicultura regional no es solo una industria productiva: es parte de la identidad costera de Los Lagos, una fuente de trabajo genuinamente territorial y un sector con proyección internacional real. Las oportunidades existen —mercados en crecimiento, tecnología disponible, apoyo institucional activo— pero solo se materializarán si la industria avanza en cohesión gremial, adopción tecnológica y cumplimiento regulatorio con visión de largo plazo.

Estación Emprende seguirá cubriendo esta industria desde el territorio, porque las decisiones que se toman hoy en una balsa en el Canal Dalcahue tienen consecuencias que llegan hasta las góndolas de supermercados en Madrid y San Francisco. Eso merece atención, análisis y debate informado.

Preguntas clave para reflexionar

• ¿Está su empresa o emprendimiento preparado para cumplir las nuevas exigencias de trazabilidad del mercado europeo antes de que se vuelvan obligatorias?
• ¿Conoce los instrumentos de CORFO e INDAP disponibles hoy para mitilicultores de pequeña escala en la Región de Los Lagos?
• ¿Cómo está gestionando actualmente los residuos sólidos (valvas, biofouling) de su concesión acuícola frente a las exigencias de la SMA?
• ¿Su organización o asociación gremial tiene acceso a los modelos predictivos de FAN desarrollados por la UACh o el Centro i~mar para anticipar vedas?
• ¿Qué rol está jugando la innovación y la economía circular en su cadena productiva, y qué barreras concretas le impiden avanzar más rápido?